Patofisiologi dakriosistitis umumnya didahului oleh obstruksi pada sistem lakrimalis yang menyebabkan air mata tidak dapat mengalir dengan baik (stagnan). Air mata dan debris yang menumpuk pada sistem lakrimalis menjadi media yang baik bagi organisme patogen untuk berkembang biak.

Patogen umumnya berasal dari konjungtiva dan palpebra, sangat jarang bersumber dari penyebaran hematogen. Infeksi organisme pada sistem lakrimalis akan menimbulkan inflamasi pada sakus lakrimalis yang bermanifestasi sebagai pembengkakan di bagian inferomedia regio orbita.[4,6]

Kasus dakriosistitis akut pada anak-anak biasanya disebabkan oleh obstruksi duktus nasolakrimalis kongenital. Sinusitis, trauma pada duktus, benda asing, dan inokulasi langsung mikroorganisme juga dapat menjadi penyebab dakriosistitis akut. Infeksi sendiri dapat menimbulkan peradangan yang kemudian berujung pada fibrosis dan obstruksi sekunder.[5]