Patofisiologi endokarditis didahului oleh kerusakan endokardium yang diikuti terjadinya bakteremia. Kerusakan endokardium dapat terjadi akibat aliran turbulen pada penyakit katup jantung, atau dari trauma mekanik langsung dari insersi elektroda atau kateter.[1,2]

Lesi pada Lapisan Endokardium Sebagai Prekursor Endokarditis

Lesi turbulen tinggi seperti defek kecil pada septum ventrikel dengan katup yang stenosis atau jet lesion akan menyebabkan kerusakan lokal yang lebih besar dibandingkan defek yang berkaitan dengan permukaan yang lebar atau aliran turbulen rendah. Endokardium yang rusak menjadi titik lokasi agregasi platelet dan aktivasi kaskade koagulasi, yang akhirnya berkembang menjadi vegetasi trombotik steril atau non-bakterial.