Komplikasi skin test bisa berupa reaksi alergi yang berat seperti syok anafilaksis yang mengancam nyawa.

Karena pemeriksaan ini menggunakan bahan yang bisa memicu alergi, maka dapat timbul sensitisasi, reaksi iritan, dan kambuhnya. Selain itu, juga bisa muncul fenomena Koebner, reaksi positif yang persisten, reaksi anafilaktoid, lesi hiperpigmentasi atau hipopigmentasi pada lokasi dengan reaksi positif, infeksi sekunder, dan terbentuknya skar atau keloid.[8-10]