Pengawasan klinis selama menggunakan protamin sulfat berupa pemantauan parameter pembekuan darah, terutama pada pasien yang menjalani prosedur operasi dengan durasi yang panjang dan melibatkan dosis berulang protamin sulfat.

Efek perdarahan kembali (rebound bleeding effect) dapat terjadi hingga 18 jam pasca operasi yang akan berespon dengan dosis lanjutan protamin sulfat.

Selain itu, juga perlu dilakukan pemantauan adanya tanda-tanda hipersensitivitas, efek samping, dan pemantauan tanda vital karena injeksi protamin sulfat secara cepat dapat menyebabkan hipotensi dan reaksi anafilaktoid. [12]