Edukasi pasien yang perlu diberikan tentang endoskopi atau endoscopy gastrointestinal adalah indikasi tindakan yang bersifat diagnostik seperti pada kasus ulkus peptikum dan kanker kolon atau indikasi yang bersifat terapeutik seperti ekstraksi benda asing.

Dokter juga perlu menjelaskan persiapan yang perlu dilakukan, seperti puasa minuman dan makanan serta obat apa saja yang bisa dikonsumsi. Mayoritas obat-obat yang rutin dikonsumsi oleh pasien dengan penyakit kronis umumnya bisa dilanjutkan, tetapi dokter sebaiknya tetap mengevaluasi secara individual.

Dokter juga perlu menjelaskan risiko komplikasi yang mungkin timbul, seperti laserasi rektum, cedera oral, perdarahan saluran cerna, perforasi, serta infeksi. Setelah semua informasi dijelaskan, dokter meminta informed consent dari pasien.